CAIRN.INFO : Matières à réflexion

La chimie théorique, outil incontournable pour le développement de la chimie au XXIe siècle, apporte un éclairage précieux sur de nombreux travaux expérimentaux. Elle permet de représenter, d’interpréter et de prédire des phénomènes à l’échelle moléculaire. Elle fournit en permanence des développements méthodologiques qui permettent de repousser les limites de son applicabilité, aussi bien en termes de dimension des systèmes étudiés que de leur complexité physico-chimique. Elle exploite au mieux les développements des ordinateurs dont la puissance augmente sans cesse. L’évolution de la chimie théorique a été marquée par huit Nobel de physique et huit Nobel de chimie, dont le dernier en 2013. La place centrale qu’elle occupe dans le paysage de la recherche académique et industrielle se traduit par la présence presque systématique d’une équipe de modélisation-simulation au sein des laboratoires de recherche en chimie.
Cette chimie par le calcul, complémentaire de la chimie par la manipulation de produits, comporte une partie conceptuelle qui associe les modèles et leur transcription sous forme de logiciels et une partie numérique s’appuyant sur des moyens de calcul. Les modèles, ainsi que les méthodes développées pour les rendre opérationnels, seront exposés dans cette contribution car on ne peut pas apprécier la résolution d’un problème sans connaître l’outil avec lequel on le traite. Parmi les applications, nous verrons comment sont combinées et gérées précision et complexité dans un parcours allant des petites molécules isolées aux systèmes les plus complexes que la modélisation est capable de traiter aujourd’hui…

  1. 1 - Modèles et méthodes pour la structure électronique
    1. 1.1 - Méthodes de détermination des structures électroniques
      1. 1.1.1 - Méthodes explicitant la fonction d’onde électronique
      2. 1.1.2 - Méthode de la fonctionnelle de la densité DFT
        1. Que signifient les termes « densité », « fonctionnelle » et « théorie » ?
    2. 1.2 - Application à l’étude de mécanismes réactionnels
      1. 1.2.1 - Quelle méthode de calcul choisir ?
      2. 1.2.2 - Comment étudier la réactivité ?
      3. 1.2.3 - Quel modèle utiliser pour le système chimique ?
        1. Représentation du système
  2. 2 - La dynamique des noyaux
    1. 2.1 - Dynamique quantique
    2. 2.2 - Spectroscopie vibrationnelle
      1. 2.2.1 - Oscillateur harmonique : modèles classique et quantique
      2. 2.2.2 - Anharmonicité
      3. 2.2.3 - Évolutions des modèles théoriques
    3. 2.3 - Réactivité sous l’effet de la lumière : la photochimie
      1. 2.3.1 - Spectres d’absorption, d’émission et couleurs de colorants organiques
      2. 2.3.2 - Isomérisation photo-induite d’un ligand dans un complexe de Re(I)
  3. 3 - Dynamique moléculaire classique
    1. 3.1 - Énergie potentielle
      1. 3.1.1 - Les champs de force : concepts et hypothèses de base
      2. 3.1.2 - Champs de force : évolutions et limites
    2. 3.2 - Mécanique moléculaire : méthodes et performances
    3. 3.3 - Le système et son environnement : les méthodes hybrides
      1. 3.3.1 - Identification des parties QM et MM et interactions
      2. 3.3.2 - Jonctions entre les parties QM et MM
      3. 3.3.3 - Photo-isomérisation du chromophore rétinal dans la rhodopsine
  4. 4 - Les systèmes complexes
    1. 4.1 - Les liquides
      1. 4.1.1 - Définition des liquides
      2. 4.1.2 - Concepts de base de la mécanique statistique des liquides moléculaires
        1. La fonction de distribution de paires g(r)
        2. Propriétés d’une gouttelette d’eau confinée : propriétés électroniques et spectroscopiques IR
      3. 4.1.3 - Les liquides ioniques
      4. 4.1.4 - Calcul de l’énergie libre
      5. 4.1.5 - La thermodynamique moléculaire
    2. 4.2 - Les protéines et les systèmes biologiques
      1. 4.2.1 - Échantillonnage de l’espace des conformations
      2. 4.2.2 - Représentations moléculaires
      3. 4.2.3 - Cibles critiques pour la santé
  5. 5 - Conclusions
Gilberte Chambaud
Gilberte Chambaud est professeur émérite à l’université Paris-Est Marne-la- Vallée, membre du laboratoire MSME (Modélisation et simulation multi-échelle) (CNRS/université Paris Est Marne-la-Vallée). Son domaine de recherche est la chimie théorique et plus particulièrement la spectroscopie ro-vibrationnelle et les interactions molécules/surface. Elle a été fondatrice du RFCT (Réseau français de chimie théorique) en 2006. Après cinq années à la direction de l’Institut de chimie du CNRS (2006-2011), elle s’est investie dans les problèmes de modélisation multi-échelle, en partant d’une approche atomistique pour générer des paramètres transférables à l’échelle mésoscopique. http://msme.u-pem.fr/equipe-chimie-theorique/personnel/permanents/chambaud-gilberte/.
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Mis en ligne sur Cairn.info le 01/02/2016
https://doi.org/10.3917/edmat.varen.2014.01.0359
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